30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1639 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  361  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  83.24 
 
 
185 aa  310  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  40.23 
 
 
171 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  48.91 
 
 
464 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  48.91 
 
 
476 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  56.94 
 
 
492 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  39.45 
 
 
334 aa  71.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  53.09 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
615 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  33.99 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  47.3 
 
 
593 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 
620 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  50.7 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  53.33 
 
 
389 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  46.05 
 
 
377 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  48.48 
 
 
241 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  45.59 
 
 
437 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  41.03 
 
 
319 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  44.12 
 
 
435 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  27.4 
 
 
336 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 
464 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
351 aa  55.1  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  37.5 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 
482 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  27.45 
 
 
377 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 
634 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  35.06 
 
 
379 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  30.67 
 
 
287 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  31.03 
 
 
285 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
634 aa  41.2  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>