More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1348 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
311 aa  639  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  83.28 
 
 
312 aa  534  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
310 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  41.2 
 
 
705 aa  221  2e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  42.61 
 
 
313 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  41.47 
 
 
298 aa  213  3e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  44.25 
 
 
308 aa  213  4e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  45.04 
 
 
324 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 
324 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  41.9 
 
 
299 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  35.48 
 
 
652 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.28 
 
 
355 aa  206  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
336 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  41.85 
 
 
299 aa  201  1e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  39.31 
 
 
324 aa  200  2e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  42.01 
 
 
311 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  40.3 
 
 
324 aa  198  1e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  40.93 
 
 
318 aa  197  2e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
306 aa  197  2e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
714 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 
306 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  40.15 
 
 
318 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 
318 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 
318 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  43.8 
 
 
317 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 
324 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  39.76 
 
 
334 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  36.47 
 
 
290 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 
293 aa  184  2e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
294 aa  179  6e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
334 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  36.03 
 
 
289 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
304 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
329 aa  174  2e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
307 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 
379 aa  172  6e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 
361 aa  172  8e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
333 aa  172  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
313 aa  165  7e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.94 
 
 
311 aa  164  1e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
308 aa  164  1e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
340 aa  164  1e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
387 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 
360 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  38.27 
 
 
325 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  5.58134e-07  hitchhiker  4.72149e-06 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
317 aa  158  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 
310 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 
318 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
314 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 
303 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  37.15 
 
 
319 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
282 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
314 aa  148  1e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
318 aa  146  4e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 
319 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
298 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 
312 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
306 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
327 aa  141  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  31.21 
 
 
301 aa  141  1e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
310 aa  140  2e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
327 aa  141  2e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
327 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
334 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
334 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
342 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
318 aa  136  6e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  38.31 
 
 
1340 aa  135  6e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
331 aa  134  2e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
312 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  27.6 
 
 
297 aa  131  1e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  27.86 
 
 
297 aa  131  1e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
305 aa  131  1e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
341 aa  132  1e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
297 aa  130  4e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
308 aa  130  4e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
337 aa  128  1e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  29.82 
 
 
330 aa  128  1e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
296 aa  125  8e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
296 aa  125  8e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
296 aa  125  8e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
328 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
310 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.84 
 
 
322 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
301 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  2.47035e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
324 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.66 
 
 
301 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.74 
 
 
286 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  33.85 
 
 
274 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  31.65 
 
 
358 aa  122  1e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  34.17 
 
 
283 aa  121  1e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
340 aa  122  1e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
378 aa  122  1e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
291 aa  122  1e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
324 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
346 aa  121  2e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.0329e-13 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
305 aa  120  2e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
1162 aa  120  2e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  30.45 
 
 
288 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
272 aa  119  5e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  3.44524e-05  normal  0.888688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>