More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2435 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  74.5 
 
 		 152 aa  224  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  56.38 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  54.79 
 
 		 155 aa  173  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  60.71 
 
 		 154 aa  173  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  54.55 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  56.38 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  58.82 
 
 		 161 aa  167  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  53.33 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  53.64 
 
 		 159 aa  156  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  49.64 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  49.23 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  49.23 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  49.23 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  49.23 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  48.53 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  46.76 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  50.38 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  45.99 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  44.6 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  43.88 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  43.28 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  45.38 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  39.74 
 
 		 183 aa  123  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  41.67 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  40.29 
 
 		 185 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  44.14 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  40.91 
 
 		 174 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  40.71 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  41.48 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  40.77 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  38.46 
 
 		 183 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  41.22 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  41.22 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  41.22 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  41.54 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  40.29 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  41.22 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  41.22 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  42.31 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  41.22 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.43 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  41.22 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  41.22 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.77 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  40 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.52 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  39.13 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  41.22 
 
 		 174 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  38.52 
 
 		 179 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.57 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  41.22 
 
 		 175 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.57 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  41.22 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  41.22 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  36.24 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.46 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  40.46 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  38.46 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.57 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  39.69 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  39.23 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  40.77 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  39.69 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  35.71 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  38.03 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  38.17 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  39.23 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  35.17 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.17 
 
 		 162 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.83 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.9 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  38.06 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.17 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  40.88 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  41.22 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  36.57 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.93 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.24 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  35.17 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>