165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4027 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  100 
 
 		 163 aa  333  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  93.79 
 
 		 161 aa  315  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  90.06 
 
 		 161 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  85.71 
 
 		 161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  83.23 
 
 		 161 aa  278  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0951  putative peroxiredoxin  87.59 
 
 		 145 aa  262  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.148763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2686  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  79.5 
 
 		 161 aa  256  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579754  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  58.64 
 
 		 160 aa  193  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  59.01 
 
 		 161 aa  190  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  57.86 
 
 		 160 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  57.86 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  59.01 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  57.86 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  57.41 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  58.39 
 
 		 161 aa  187  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  56.52 
 
 		 162 aa  184  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  57.76 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  57.14 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  54.49 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  51.55 
 
 		 161 aa  173  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  50.93 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  54.04 
 
 		 161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  53.8 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0530  redoxin domain-containing protein  53.42 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  47.83 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.47 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  50.31 
 
 		 161 aa  156  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0113  redoxin  52.23 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.31 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  50.31 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  52.5 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  50.31 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3007  redoxin domain-containing protein  47.53 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.69 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  49.06 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  49.69 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  49.69 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  48.43 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.83 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  49.06 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.53 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  49.06 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  49.06 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  48.43 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  46.91 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  46.06 
 
 		 249 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  49.06 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  45.96 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  51.57 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  48.41 
 
 		 247 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  48.43 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  45.62 
 
 		 243 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  50.9 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  46.88 
 
 		 242 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  52.1 
 
 		 168 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  52.07 
 
 		 185 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  45.34 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  50.89 
 
 		 192 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  50.91 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  47.17 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  47.5 
 
 		 247 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.5 
 
 		 183 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  47.27 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  46.45 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.7 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  52.1 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  47.56 
 
 		 243 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  47.2 
 
 		 245 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  47.56 
 
 		 243 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  47.56 
 
 		 243 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  47.56 
 
 		 243 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.17 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  46.99 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0439  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2325  redoxin domain-containing protein  45 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  44.94 
 
 		 245 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  43.29 
 
 		 246 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  44.94 
 
 		 243 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  43.59 
 
 		 242 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  45.18 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.17 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  46.2 
 
 		 238 aa  134  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  44.38 
 
 		 248 aa  134  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  45.22 
 
 		 243 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  45.22 
 
 		 243 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  45.57 
 
 		 243 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  47.34 
 
 		 168 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  46.2 
 
 		 248 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  46.2 
 
 		 248 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  42.68 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  44.58 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  45.73 
 
 		 242 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>