245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3673 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  68.4 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  67.81 
 
 		 248 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  66.95 
 
 		 246 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  64.66 
 
 		 429 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  60.87 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  61.3 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  54.2 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  52.97 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  54.72 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  53.77 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  54.5 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  54.11 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  45.19 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  41.95 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  48.08 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  42.49 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  40.33 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  38.91 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  39.41 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  42.86 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  40.48 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  40.76 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  40.93 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  37.04 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  39.72 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  39.11 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  40.08 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  39.63 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  39.63 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  34.72 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  45.58 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  40.32 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  40.49 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  39.26 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  38.14 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  44.19 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  36.29 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  37.05 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  34.09 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  40.54 
 
 		 494 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  38.24 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  47.87 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  38.6 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  34.85 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  31.89 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  37.2 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  35.15 
 
 		 220 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  33.93 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  37.02 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  39.89 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  35.06 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  31.49 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  35.15 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.21 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  37.8 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  39.33 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  37.39 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  38.06 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  38.52 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  36.91 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  36.51 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  33.75 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  37.3 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  37.6 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  37.04 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31.2 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  32.93 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  32.76 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  39.47 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  32.59 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  40.28 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  31.22 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  32.86 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  34.71 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.23 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  35.34 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  37.08 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  33.33 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  34.85 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  34.03 
 
 		 373 aa  96.3  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  31.31 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.16 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2740  6-phosphogluconolactonase  37.68 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4432  6-phosphogluconolactonase  34.13 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.1 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0971  6-phosphogluconolactonase  30.49 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.265153  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  30.28 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>