More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0350 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 164 aa  344  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  91.91 
 
 		 165 aa  265  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  91.91 
 
 		 168 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  86.76 
 
 		 165 aa  255  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  82.76 
 
 		 149 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  86.76 
 
 		 162 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  86.03 
 
 		 162 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  58.74 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  61.94 
 
 		 171 aa  191  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  61.9 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  53.7 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  52.47 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  58.67 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  57.14 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  57.14 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  60.16 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  57.78 
 
 		 139 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  57.04 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  59.2 
 
 		 140 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  56.15 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  55.73 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  55.73 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  55.73 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  55.47 
 
 		 136 aa  150  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  51.2 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  49.62 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  48.53 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  50 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  52.8 
 
 		 174 aa  133  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  51.91 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  49.61 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  49.61 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  54.4 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  43.54 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  47.79 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  38.89 
 
 		 131 aa  91.7  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  39.06 
 
 		 141 aa  91.3  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  33.86 
 
 		 145 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  36.27 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  30.47 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  33.94 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  36.08 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  29.6 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  35.71 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  36.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  32.46 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  35.58 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  36.63 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  32.28 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  40.62 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  34.69 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  34.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  34.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  34.69 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  34.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  30.47 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  35.8 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  34.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  34.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>