17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2056 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  90.51 
 
 		 253 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  58.1 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  52.99 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  54.18 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  53.78 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  52.99 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  45.56 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  51.02 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  43.21 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  44.44 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  44.44 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  47.37 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  30.67 
 
 		 524 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  26.2 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  29.89 
 
 		 526 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.86 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>