131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0736 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  96.3 
 
 		 426 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0736  umuC protein  100 
 
 		 81 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  87.65 
 
 		 426 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  82.28 
 
 		 424 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  78.48 
 
 		 424 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  71.6 
 
 		 426 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  66.67 
 
 		 420 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  65.79 
 
 		 419 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  67.11 
 
 		 425 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  67.11 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  67.11 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  61.54 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  61.84 
 
 		 492 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  64.94 
 
 		 424 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  64.94 
 
 		 424 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  66.23 
 
 		 424 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  66.23 
 
 		 424 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  63.16 
 
 		 418 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  65.33 
 
 		 497 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  63.16 
 
 		 423 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  65.28 
 
 		 423 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  61.84 
 
 		 424 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  62.16 
 
 		 442 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  64.47 
 
 		 424 aa  103  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  64.47 
 
 		 423 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  63.16 
 
 		 420 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  59.21 
 
 		 425 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  59.21 
 
 		 418 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  59.21 
 
 		 418 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  62.16 
 
 		 427 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  64.47 
 
 		 420 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  63.16 
 
 		 422 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  57.33 
 
 		 450 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  60 
 
 		 442 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  58.67 
 
 		 421 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  59.21 
 
 		 437 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  61.84 
 
 		 422 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  55 
 
 		 439 aa  97.1  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  56.58 
 
 		 423 aa  97.1  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1200  DNA-directed DNA polymerase  59.21 
 
 		 432 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  60 
 
 		 423 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  57.33 
 
 		 443 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  53.95 
 
 		 432 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  55.26 
 
 		 426 aa  94.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  57.33 
 
 		 478 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  61.84 
 
 		 422 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  56.58 
 
 		 426 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  52.63 
 
 		 432 aa  94  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  61.84 
 
 		 422 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  55.84 
 
 		 422 aa  93.6  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10201  putative UmuC protein  56.41 
 
 		 430 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.31245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  53.66 
 
 		 446 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0862  DNA-directed DNA polymerase  56.76 
 
 		 428 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.826564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  60.53 
 
 		 422 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  55.26 
 
 		 432 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  59.21 
 
 		 422 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  53.95 
 
 		 423 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09231  putative UmuC protein  56.76 
 
 		 428 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09211  putative UmuC protein  56.76 
 
 		 428 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  55.26 
 
 		 422 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  55.26 
 
 		 430 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  53.95 
 
 		 426 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  51.32 
 
 		 449 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0172  DNA-repair protein  53.95 
 
 		 218 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1178  DNA-directed DNA polymerase  54.05 
 
 		 424 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0736762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  58.11 
 
 		 422 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  47.5 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  57.89 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1209  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  69.09 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0129204  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  51.32 
 
 		 418 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  53.95 
 
 		 424 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  53.95 
 
 		 424 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  52.63 
 
 		 418 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  52.63 
 
 		 418 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  52.63 
 
 		 418 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  52.7 
 
 		 437 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  51.32 
 
 		 418 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  51.32 
 
 		 418 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  50 
 
 		 418 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  48.78 
 
 		 428 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  50 
 
 		 418 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  50 
 
 		 418 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  50 
 
 		 418 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  51.32 
 
 		 418 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  48.68 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  53.95 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 436 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0274  DNA-directed DNA polymerase  52.78 
 
 		 425 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0854208  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4172  DNA-directed DNA polymerase  46.75 
 
 		 416 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.06239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09431  putative UmuC protein  52.78 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0552438 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  49.33 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1781  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  50 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>