More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0274 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0274  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
425 aa  865    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0854208  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09431  putative UmuC protein  98.35 
 
 
425 aa  851    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0552438 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1178  DNA-directed DNA polymerase  44.1 
 
 
424 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0736762  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  45.93 
 
 
422 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  43.4 
 
 
424 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  45.99 
 
 
424 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09211  putative UmuC protein  47.97 
 
 
428 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09231  putative UmuC protein  47.49 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0862  DNA-directed DNA polymerase  47.73 
 
 
428 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.826564  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10201  putative UmuC protein  46.92 
 
 
430 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.31245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 
418 aa  296  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  36.07 
 
 
497 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  36 
 
 
423 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  32.94 
 
 
423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 
424 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  35.8 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 
423 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 
424 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  35.18 
 
 
422 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  35.56 
 
 
424 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  35.95 
 
 
423 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  34.94 
 
 
422 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  34.94 
 
 
422 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  35.61 
 
 
424 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  35.05 
 
 
418 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  35.49 
 
 
425 aa  260  3e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  34.94 
 
 
422 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 
422 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  34.75 
 
 
424 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
492 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  35.42 
 
 
422 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  35.42 
 
 
422 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  35.42 
 
 
422 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  35.42 
 
 
422 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  35.42 
 
 
422 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  35.42 
 
 
422 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  35.42 
 
 
422 aa  256  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  35.42 
 
 
422 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  33.96 
 
 
423 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.37 
 
 
420 aa  254  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  34.6 
 
 
421 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  34.21 
 
 
418 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 
424 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  33.72 
 
 
432 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 
446 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  33.57 
 
 
450 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  32.54 
 
 
427 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.03 
 
 
442 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  34.06 
 
 
426 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  31.76 
 
 
420 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  34.19 
 
 
426 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  36.12 
 
 
420 aa  246  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  33.81 
 
 
422 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 
426 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 
439 aa  245  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  33.1 
 
 
437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  33.17 
 
 
437 aa  243  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  33.02 
 
 
430 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  32.39 
 
 
426 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  34.2 
 
 
418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  34.42 
 
 
436 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  34.2 
 
 
418 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
426 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  34.61 
 
 
423 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  33.1 
 
 
426 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  32.13 
 
 
418 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 
418 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  33.72 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  32.85 
 
 
418 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  35.73 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  31.99 
 
 
423 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  31.4 
 
 
442 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  32.13 
 
 
418 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  33.76 
 
 
432 aa  233  6e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  32.46 
 
 
419 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  35.49 
 
 
418 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  31.85 
 
 
428 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  33.02 
 
 
421 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 
418 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  30.07 
 
 
449 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  33.81 
 
 
425 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  33.88 
 
 
425 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  33.81 
 
 
425 aa  229  9e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  31.19 
 
 
443 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  32.3 
 
 
418 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  30.32 
 
 
478 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1200  DNA-directed DNA polymerase  32.69 
 
 
432 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 
417 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  31.1 
 
 
417 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  30.94 
 
 
418 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  32.46 
 
 
424 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  31.65 
 
 
418 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  33.56 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  31.03 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 
418 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  31.73 
 
 
421 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.31 
 
 
419 aa  216  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  32.3 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>