159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0022 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  725  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0029  hypothetical protein  94.29 
 
 
350 aa  656  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00048077  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0034  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  72.51 
 
 
386 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.6789e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 
323 aa  197  2e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
342 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  34.73 
 
 
335 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.77 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  37.77 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  34.73 
 
 
335 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  37.77 
 
 
345 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
327 aa  184  2e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 
355 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
334 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  36.01 
 
 
334 aa  183  4e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
358 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
345 aa  180  3e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
346 aa  180  3e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  32.76 
 
 
371 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
338 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 
327 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  35.47 
 
 
329 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
342 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  35.69 
 
 
327 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
327 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
358 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
328 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
347 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
347 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
347 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 
345 aa  175  1e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
353 aa  175  1e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 
345 aa  175  1e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  37.46 
 
 
345 aa  175  1e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  35.05 
 
 
340 aa  174  2e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  35.58 
 
 
340 aa  174  2e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
323 aa  174  2e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
321 aa  174  2e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
326 aa  174  2e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
347 aa  174  2e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 
340 aa  174  2e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  35.58 
 
 
340 aa  174  2e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  35.05 
 
 
340 aa  174  3e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
327 aa  173  3e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  35.05 
 
 
340 aa  173  3e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  34.64 
 
 
325 aa  173  3e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  34.73 
 
 
340 aa  173  4e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 
323 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  34.41 
 
 
340 aa  172  7e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  34.73 
 
 
340 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  8.31591e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  34.22 
 
 
326 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.75 
 
 
325 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  35.53 
 
 
323 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  35.28 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  35.6 
 
 
344 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  33.33 
 
 
417 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  32.24 
 
 
340 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  36.3 
 
 
337 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  32.48 
 
 
330 aa  166  7e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  31.66 
 
 
322 aa  166  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  33.76 
 
 
339 aa  165  1e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  35.06 
 
 
372 aa  164  1e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  32.8 
 
 
338 aa  165  1e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.05 
 
 
318 aa  164  2e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 
321 aa  164  2e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  33.83 
 
 
321 aa  164  2e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  34.75 
 
 
348 aa  164  2e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  36.36 
 
 
326 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  36.36 
 
 
326 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  36.36 
 
 
326 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  34.88 
 
 
341 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  33.66 
 
 
384 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  34.15 
 
 
326 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  34.38 
 
 
379 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  32.97 
 
 
387 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  30.11 
 
 
340 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
352 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  30.11 
 
 
340 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
344 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  30.63 
 
 
319 aa  156  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  30.63 
 
 
319 aa  156  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  30.63 
 
 
319 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  35.44 
 
 
342 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  33.58 
 
 
334 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
332 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
354 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  32.03 
 
 
327 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  31.49 
 
 
327 aa  148  1e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  30.03 
 
 
320 aa  147  2e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  29.58 
 
 
332 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  30 
 
 
332 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  31.39 
 
 
326 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  36.51 
 
 
331 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 
330 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
332 aa  142  1e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>