More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2662 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  86.8 
 
 		 303 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  84.82 
 
 		 303 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  86.76 
 
 		 272 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  54.75 
 
 		 308 aa  341  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  57.09 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  50.55 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  46.67 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  47.47 
 
 		 302 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  43.31 
 
 		 305 aa  265  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  49.03 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  46.13 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  49.27 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  47.1 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  43.96 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  45.86 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  43.68 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  48.61 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  44.12 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  41.49 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  39.73 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  40.22 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  39.73 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  36.13 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  40.77 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  40.08 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  36.57 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  37.36 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  35.63 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  31.05 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  29.96 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  26.88 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  28.01 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  25.93 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 406 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  29.95 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  28.01 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  26.76 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  24.44 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0536  putative aldose reductase  25.42 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0284216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  27.55 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  28.21 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  28.65 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  26.19 
 
 		 413 aa  68.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  26.96 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  27.97 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  24.44 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  28.87 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  26.25 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  31.6 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  25.18 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  32.94 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  28.52 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  29.28 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  27.21 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  24.01 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  27.84 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.91 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  27.21 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  29.79 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  27.21 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  27.54 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  28.85 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  26.7 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  28.02 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  24.07 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  26.47 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  29.21 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  27.75 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.72 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.72 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  26.67 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.72 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  26.09 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.72 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.32 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  29.84 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  25.56 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  25.79 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  26.17 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  26.72 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  24.35 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  25.1 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2012  aldo/keto reductase  29.09 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  24.01 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  28.16 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  28.92 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  28.04 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  28.27 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  26.15 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  25.73 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>