More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0300 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  203  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  79.81 
 
 
104 aa  170  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  78.85 
 
 
104 aa  170  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  80.77 
 
 
104 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  79.81 
 
 
104 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  76.92 
 
 
104 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  82.69 
 
 
104 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  78.85 
 
 
104 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  59.62 
 
 
104 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  60.58 
 
 
104 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  60.82 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  56.31 
 
 
110 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  59.8 
 
 
103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  62.77 
 
 
105 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  56.44 
 
 
102 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  59.18 
 
 
112 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  59.18 
 
 
112 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  57.29 
 
 
99 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  53.61 
 
 
102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  53 
 
 
100 aa  116  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  56.57 
 
 
113 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  50.98 
 
 
103 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  54.21 
 
 
108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  52.38 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  55.67 
 
 
102 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  53.06 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  45.1 
 
 
103 aa  105  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  49.49 
 
 
111 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  52 
 
 
112 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  54.64 
 
 
113 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  51.49 
 
 
115 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  54 
 
 
127 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  48.45 
 
 
112 aa  103  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  53.49 
 
 
104 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  60.98 
 
 
108 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  53.93 
 
 
99 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  46.08 
 
 
103 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  42.16 
 
 
103 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  61.46 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  59.04 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  54.74 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  57.83 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  57.83 
 
 
109 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  53 
 
 
98 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  46.39 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  55.81 
 
 
109 aa  93.6  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  43.14 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  45.63 
 
 
107 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  45.63 
 
 
107 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  49.48 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  46.46 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  47.06 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  46.08 
 
 
109 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  45.54 
 
 
108 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2768  hypothetical protein  46.67 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  51.85 
 
 
105 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  45.1 
 
 
110 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  46.74 
 
 
100 aa  87  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  44.9 
 
 
109 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  47.83 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  47.73 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  43.75 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  45.83 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  44.79 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  44.66 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  51.19 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  45.1 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  48.57 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  43.27 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  43.14 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  42.31 
 
 
108 aa  84  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  43.88 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  54.93 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  54.93 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  43.14 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  42.16 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  42.16 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  42.16 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  42.16 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  41.58 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  41.18 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  41.18 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  42.16 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>