More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2705 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  61.3 
 
 		 508 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.39 
 
 		 503 aa  657    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.61 
 
 		 503 aa  680    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  62.67 
 
 		 502 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.39 
 
 		 503 aa  657    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 		 502 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 502 aa  645    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.91 
 
 		 501 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 		 502 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 		 502 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0315  ATP synthase F1, alpha subunit  71.76 
 
 		 534 aa  757    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 502 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 502 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.09 
 
 		 510 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 502 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.06 
 
 		 502 aa  667    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.83 
 
 		 509 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  60 
 
 		 501 aa  642    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.27 
 
 		 502 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  57.9 
 
 		 512 aa  638    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.71 
 
 		 510 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.36 
 
 		 502 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.1 
 
 		 510 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.42 
 
 		 512 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.27 
 
 		 502 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0065  ATP synthase F1 subunit alpha  67.33 
 
 		 532 aa  682    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 		 502 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 		 502 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.93 
 
 		 526 aa  942    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  89.73 
 
 		 526 aa  963    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1712  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.8 
 
 		 526 aa  697    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000192165  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  90.87 
 
 		 526 aa  986    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.79 
 
 		 526 aa  922    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.82 
 
 		 503 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.02 
 
 		 502 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 502 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  62.96 
 
 		 541 aa  658    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.74 
 
 		 501 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  69.96 
 
 		 524 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  91.25 
 
 		 526 aa  971    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.32 
 
 		 504 aa  648    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  64.17 
 
 		 507 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.57 
 
 		 510 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.38 
 
 		 510 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1059  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.42 
 
 		 525 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 		 510 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.38 
 
 		 509 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.56 
 
 		 502 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.09 
 
 		 502 aa  648    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.84 
 
 		 505 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0396  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.65 
 
 		 524 aa  742    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 502 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  59.7 
 
 		 512 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.26 
 
 		 502 aa  656    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.8 
 
 		 505 aa  648    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.38 
 
 		 510 aa  634    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 		 502 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.58 
 
 		 512 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1233  ATP synthase F1, alpha subunit  69.42 
 
 		 525 aa  707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.88 
 
 		 509 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 526 aa  1055    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.91 
 
 		 501 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.27 
 
 		 502 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.52 
 
 		 526 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.47 
 
 		 502 aa  653    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.66 
 
 		 502 aa  654    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  63.25 
 
 		 501 aa  668    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.57 
 
 		 510 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.09 
 
 		 502 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.91 
 
 		 501 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4632  ATP synthase F1, alpha subunit  68.64 
 
 		 525 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0663006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.81 
 
 		 502 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 502 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  60.84 
 
 		 507 aa  643    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  62.12 
 
 		 509 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 		 502 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.37 
 
 		 502 aa  656    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03060  ATP synthase subunit A  65.71 
 
 		 524 aa  683    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.77 
 
 		 505 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  63.78 
 
 		 507 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.6 
 
 		 504 aa  658    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.46 
 
 		 505 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 		 502 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 		 502 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  92.78 
 
 		 526 aa  982    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 		 510 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  60.77 
 
 		 507 aa  639    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 		 509 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.5 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.07 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.23 
 
 		 505 aa  632  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.88 
 
 		 509 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.19 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.19 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.09 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  60.04 
 
 		 501 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.67 
 
 		 502 aa  631  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.11 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>