More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2417 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  83 
 
 		 447 aa  796    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  83.45 
 
 		 447 aa  801    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  83.89 
 
 		 447 aa  808    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  79.64 
 
 		 450 aa  746    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  79.14 
 
 		 448 aa  740    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  100 
 
 		 447 aa  929    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  85.46 
 
 		 447 aa  825    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  64.73 
 
 		 443 aa  618  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  67.76 
 
 		 455 aa  614  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  68 
 
 		 455 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  65.88 
 
 		 447 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  63.43 
 
 		 445 aa  596  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  63.97 
 
 		 436 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3738  citrate synthase I  64.87 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.680995  normal  0.033422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3488  citrate synthase I  64.4 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0581  citrate synthase I  64.64 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  64 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  60.94 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  54.91 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  54.48 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  54.52 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  54.06 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  55.24 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  53.69 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  54.21 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  53.6 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  53.7 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  52.86 
 
 		 433 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  53.49 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  55.68 
 
 		 432 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  55.24 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  52.34 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  53.94 
 
 		 435 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  54.31 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  53.94 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  52.74 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  52.74 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  53.7 
 
 		 430 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  54.78 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  52.74 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  53.11 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  53.26 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  52.28 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  51.72 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  53.98 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  53.92 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  53.13 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  51.84 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  52.28 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  52.89 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  52.57 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  52.05 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  52.44 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  52.67 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  51.26 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  51.83 
 
 		 433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  53.37 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  51.26 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  52.52 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  54.81 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  51.63 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  52.52 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  52.05 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  55.04 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  55.56 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  51.6 
 
 		 433 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  52.57 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  51.39 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  51.93 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  50.91 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  55.08 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  51.92 
 
 		 429 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  53.96 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  52.98 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  53.12 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  53.47 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  52.16 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  54.57 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  54.33 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  50.58 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  54.57 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  51.52 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  52.63 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  55.47 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  55.47 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  55.5 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  52.49 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  53.95 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  53.85 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>