More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0303 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  91.6 
 
 		 131 aa  246  8e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  90.08 
 
 		 131 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2409  30S ribosomal protein S8  89.31 
 
 		 131 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2215  30S ribosomal protein S8  88.55 
 
 		 131 aa  238  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000186287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  81.54 
 
 		 131 aa  224  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2050  30S ribosomal protein S8  76.92 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00419842  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  48.46 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  49.24 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  44.78 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  49.23 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 		 133 aa  120  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  46.97 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  45.93 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2980  30S ribosomal protein S8  48.12 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0172  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000595155  decreased coverage  0.000051786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2310  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2674  30S ribosomal protein S8  45.11 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  46.92 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  46.51 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0064  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237116  hitchhiker  9.24625e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1721  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.518742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  43.08 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  44.36 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  44.36 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0265  ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 132 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  46.97 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  43.18 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  43.41 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  44.62 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  45.86 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  46.92 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  43.18 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  46.09 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  44.7 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0851  30S ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  43.61 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  41.35 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0293  SSU ribosomal protein S8P  46.51 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000301121  hitchhiker  0.00000201574 
 
 
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  43.18 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  46.21 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  44.7 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  44.12 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  45.74 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1036  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  42.31 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  43.94 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  41.86 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1932  30S ribosomal protein S8  45.86 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  42.31 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0067  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 		 131 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000554251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>