298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0219 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 118 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  83.05 
 
 		 118 aa  204  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  83.9 
 
 		 117 aa  197  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  80.51 
 
 		 118 aa  192  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  79.31 
 
 		 118 aa  190  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  71.19 
 
 		 117 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  69.49 
 
 		 118 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  51.02 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  46.94 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  50.62 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  49.38 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  37.97 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  43.3 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  39.6 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  42.53 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  44.32 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  44.32 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  38.95 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  38.89 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  43.18 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  43.27 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  46.88 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40.91 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  39.8 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  39.29 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  33.98 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  36.96 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  40.24 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  37.89 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  41.56 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  37.63 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  34.52 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  36.96 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  38.04 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>