More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0509 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  95.76 
 
 		 236 aa  457  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  81.78 
 
 		 236 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  80.08 
 
 		 236 aa  394  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  81.62 
 
 		 237 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  81.86 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  82.05 
 
 		 237 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  80.08 
 
 		 236 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  81.43 
 
 		 237 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  81.62 
 
 		 237 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  82.05 
 
 		 237 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  80.51 
 
 		 258 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  81.62 
 
 		 237 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  80.08 
 
 		 236 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  81.86 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  81.62 
 
 		 237 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  81.62 
 
 		 237 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  81.62 
 
 		 237 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  75.42 
 
 		 236 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  74.15 
 
 		 236 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  75 
 
 		 236 aa  363  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  74.36 
 
 		 240 aa  362  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  73.73 
 
 		 236 aa  359  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  72.22 
 
 		 240 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  72.22 
 
 		 240 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  72.65 
 
 		 240 aa  354  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  71.37 
 
 		 240 aa  354  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  71.49 
 
 		 240 aa  353  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  72.34 
 
 		 238 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  72.65 
 
 		 240 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  70.39 
 
 		 238 aa  339  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  69.07 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  72.1 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  62.93 
 
 		 238 aa  310  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  64.38 
 
 		 240 aa  305  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  63.95 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  63.68 
 
 		 239 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.18 
 
 		 239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.23 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.23 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  62.82 
 
 		 239 aa  297  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  60.68 
 
 		 242 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  60.61 
 
 		 251 aa  294  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  60.61 
 
 		 251 aa  294  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  60.61 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  60.78 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  60.09 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  58.97 
 
 		 246 aa  291  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  58.12 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.55 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  59.83 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  58.97 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  58.97 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  59.75 
 
 		 236 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  59.66 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  57.14 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.44 
 
 		 274 aa  284  8e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  57.14 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  56.47 
 
 		 237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  60.09 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  57.14 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  59.83 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  58.97 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.58 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  57.87 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.19 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  57.33 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  58.01 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  57.14 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  57.33 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  54.94 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  56.47 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  59.15 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  56.28 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  57.26 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  58.37 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  55.84 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  55.84 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.47 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  56.03 
 
 		 243 aa  277  8e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  55.79 
 
 		 235 aa  276  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  56.41 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  56.03 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  54.51 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  54.74 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  56.03 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.45 
 
 		 240 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  54.98 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  56.28 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  55.98 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  57.76 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  56.65 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  56.65 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>