More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0795 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  83.61 
 
 		 134 aa  210  7e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 135 aa  207  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 128 aa  206  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  203  7e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  203  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  201  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 133 aa  197  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 122 aa  197  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  196  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  194  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  193  8.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  75.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 127 aa  191  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  75 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  190  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 127 aa  190  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  189  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  73.98 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 135 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  72.59 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  71.53 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  188  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  188  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  187  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 123 aa  187  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 134 aa  187  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  187  5.999999999999999e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 137 aa  186  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  72.58 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  186  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  72.58 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>