60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0436 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  100 
 
 
208 aa  431  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  48.06 
 
 
209 aa  201  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  41.78 
 
 
216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  37.9 
 
 
220 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  38.5 
 
 
262 aa  154  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  38.76 
 
 
264 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  34.13 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  37.19 
 
 
209 aa  138  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  38.32 
 
 
217 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  33.94 
 
 
214 aa  128  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  34.18 
 
 
213 aa  112  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  33.51 
 
 
209 aa  111  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  31.25 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  31.16 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  29 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  28.74 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  26.13 
 
 
457 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.25 
 
 
270 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  23.94 
 
 
456 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  26.63 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  23.84 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  25.77 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  26.6 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  25.39 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  28.02 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02630  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  27.22 
 
 
453 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.38 
 
 
500 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  23.11 
 
 
451 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  23.04 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.82 
 
 
287 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25.84 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  22.51 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  24.62 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  27.13 
 
 
331 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  24.58 
 
 
447 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  27.78 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  24.88 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0665  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  24.74 
 
 
258 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.38 
 
 
329 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  24.19 
 
 
307 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.81 
 
 
628 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2720  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
455 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0378561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  22.89 
 
 
278 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  24.08 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  36.36 
 
 
424 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  24.19 
 
 
275 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1252  lipolytic protein G-D-S-L family  22.22 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  24.19 
 
 
286 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  28.1 
 
 
214 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.31 
 
 
183 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  23.92 
 
 
218 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  22.33 
 
 
228 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.97 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  27.45 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.97 
 
 
197 aa  41.6  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  26.97 
 
 
197 aa  41.6  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.97 
 
 
218 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>