30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3315 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  58.4 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  57.6 
 
 		 245 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  34.96 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  32.89 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  31.96 
 
 		 226 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  29.96 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  29.17 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  32.78 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  29.36 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  26.34 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  23.94 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  23.94 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  24.89 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  26.92 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  27.23 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  27.45 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  23.4 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  24.61 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  28.09 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  27.5 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  28.82 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0978  hypothetical protein  25.93 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  21.43 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  36.9 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2194  protein of unknown function DUF975  25.48 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4960  hypothetical protein  29.11 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  28.24 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>