292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2840 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 562 aa  1118    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  36.43 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  37.25 
 
 		 524 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  37.14 
 
 		 520 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  37.72 
 
 		 521 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  33.69 
 
 		 523 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  33.1 
 
 		 530 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  34.09 
 
 		 530 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  49.69 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  51.5 
 
 		 433 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  29.32 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  48.66 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  41.3 
 
 		 300 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  40.62 
 
 		 400 aa  140  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  39.3 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  31.02 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  31.53 
 
 		 407 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  37.15 
 
 		 413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  37.15 
 
 		 413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  32.9 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  40 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 411 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  39 
 
 		 412 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  37.37 
 
 		 408 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  36.67 
 
 		 410 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  36.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  36.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  36.5 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  36.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  34.8 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  36.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  36.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  36.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  36.19 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  38.71 
 
 		 311 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  38.1 
 
 		 406 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  34.92 
 
 		 408 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  32.35 
 
 		 411 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  34.74 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  35.79 
 
 		 397 aa  125  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  32.03 
 
 		 411 aa  123  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  39.53 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  35.45 
 
 		 404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  32.63 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  36.93 
 
 		 305 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  38.3 
 
 		 302 aa  120  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  35.26 
 
 		 397 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  37.04 
 
 		 400 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  35.83 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  32.58 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  32.79 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  34.76 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  30.26 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 		 317 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 		 317 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 		 317 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 		 317 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 		 317 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  37.16 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  32.72 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  36.07 
 
 		 396 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  37.31 
 
 		 317 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  32.8 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  30 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  31.25 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  30 
 
 		 317 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  30.6 
 
 		 305 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  34.92 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.88 
 
 		 416 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  30.42 
 
 		 317 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  30.71 
 
 		 317 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 397 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.41 
 
 		 401 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.41 
 
 		 401 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  34.39 
 
 		 401 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  33.17 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  33.53 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  27.2 
 
 		 406 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  32.07 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  33.85 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  34.57 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  33.16 
 
 		 319 aa  99.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  30.93 
 
 		 305 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  29.36 
 
 		 341 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  35.14 
 
 		 304 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3573  flagellar hook-associated protein 3  27.42 
 
 		 436 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 403 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  30.69 
 
 		 401 aa  98.2  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  33.69 
 
 		 403 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  33.69 
 
 		 403 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 		 403 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  27.5 
 
 		 405 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  30.11 
 
 		 297 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  33.56 
 
 		 296 aa  95.9  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>