34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0699 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  63.08 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  40.32 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  36.68 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  34.26 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  32.14 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  33.07 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  30.83 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.86 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2832  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.02 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3383  gas vesicle synthesis GvpLF  25.19 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2376  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.69 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2382  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.69 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.204726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2335  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.69 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.4 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.57 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.49 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  26.04 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  24.39 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.3 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4705  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.32 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  21.32 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.63 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  25.27 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.22 
 
 		 357 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.22 
 
 		 339 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3387  gas vesicle synthesis GvpLF  24 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.6 
 
 		 344 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.29 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  21.24 
 
 		 368 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3578  putative gas vesicle synthesis protein  24.76 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.75 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3262  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.76 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>