More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2817 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 325 aa  662    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 		 321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  35.43 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  35.08 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  35.83 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  33.07 
 
 		 320 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  32.68 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  33.59 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  27.9 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  32.96 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  32.31 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  31.46 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  32.73 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  30.22 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  32.95 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  32.82 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.57 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  28.66 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000021463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  29.18 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  29.18 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  32.02 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  31.85 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.12 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.12 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.12 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.12 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  28.12 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  30.42 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  29.32 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.73 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.73 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28.96 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  30.27 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  28.78 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  30.2 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  30.2 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  30.2 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  30.24 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  30.77 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  28.51 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  28.08 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  27.17 
 
 		 276 aa  99.8  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  28.31 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  30.65 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2476  rhodanese-like domain protein  25.69 
 
 		 435 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.47 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  29.47 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  32.82 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  29.34 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  30.04 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  32.31 
 
 		 277 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.08 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  29.02 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.08 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  30.8 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  30.68 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.24 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  29.69 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  31.8 
 
 		 277 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  31.02 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.16 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.94 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  31.92 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  29.66 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  29.66 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1690  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 		 435 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  29.29 
 
 		 281 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  28.91 
 
 		 282 aa  93.2  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01726  predicted thiosulfate sulfur transferase  25.99 
 
 		 435 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.382784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1885  Rhodanese domain protein  25.99 
 
 		 435 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1841  rhodanese-like domain-containing protein  26.59 
 
 		 435 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01714  hypothetical protein  25.99 
 
 		 435 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.526406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  29.3 
 
 		 647 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  28.95 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2006  rhodanese-like domain protein  24.84 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.39 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1980  rhodanese-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0372408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  30.8 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  28.87 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1875  rhodanese domain-containing protein  24.77 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.72 
 
 		 613 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  31.8 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>