More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2834 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  410  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  58.76 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  59.28 
 
 
196 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  59.69 
 
 
201 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  59.69 
 
 
201 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.76 
 
 
196 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  57.79 
 
 
197 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  57.29 
 
 
194 aa  198  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  54.4 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  54.68 
 
 
198 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.78 
 
 
203 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  55.28 
 
 
203 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  55.39 
 
 
198 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.96 
 
 
203 aa  189  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.5 
 
 
201 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  55.28 
 
 
196 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51 
 
 
201 aa  185  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  55.67 
 
 
204 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  55.83 
 
 
203 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  59.16 
 
 
215 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  54.55 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  52.76 
 
 
206 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.44 
 
 
216 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  53.92 
 
 
203 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  52.76 
 
 
206 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  57.82 
 
 
201 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.75 
 
 
207 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  57.28 
 
 
216 aa  167  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  51.94 
 
 
212 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.75 
 
 
207 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.41 
 
 
202 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  44.95 
 
 
211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.68 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  48.97 
 
 
210 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.26 
 
 
207 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.96 
 
 
202 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.76 
 
 
202 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  55.61 
 
 
202 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.23 
 
 
210 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  48.99 
 
 
208 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  47.26 
 
 
208 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  54.15 
 
 
202 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  46.19 
 
 
226 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  54.63 
 
 
202 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  54.63 
 
 
202 aa  151  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  41.62 
 
 
195 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  52.55 
 
 
197 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  49.01 
 
 
200 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.81 
 
 
212 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  45.54 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  48.21 
 
 
202 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44 
 
 
203 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.48 
 
 
203 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.48 
 
 
203 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.48 
 
 
203 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.5 
 
 
202 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  44.33 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.72 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.48 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.48 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.14 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.48 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.48 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.64 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  44.78 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  45.08 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.5 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.69 
 
 
203 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.32 
 
 
204 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.63 
 
 
215 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  41.79 
 
 
216 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.64 
 
 
226 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  40.41 
 
 
191 aa  135  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
203 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
203 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.42 
 
 
208 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.54 
 
 
212 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.18 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.24 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  41.45 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.5 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.75 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.02 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  54.55 
 
 
199 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  43.22 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.26 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  43.88 
 
 
193 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  48.4 
 
 
193 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  43.88 
 
 
193 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0828  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.75 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00106663  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  41.45 
 
 
196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  44.12 
 
 
203 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  37.31 
 
 
277 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  48.9 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  39.58 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>