More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1760 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  68.32 
 
 
203 aa  261  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  68.81 
 
 
206 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  68.32 
 
 
206 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.29 
 
 
201 aa  235  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  66.33 
 
 
201 aa  224  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  66.33 
 
 
201 aa  224  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.1 
 
 
196 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  59.9 
 
 
201 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.25 
 
 
198 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  59.69 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  58.88 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.33 
 
 
196 aa  196  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.82 
 
 
196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.76 
 
 
197 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  58.67 
 
 
202 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  57.65 
 
 
202 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  55.73 
 
 
198 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  54.55 
 
 
214 aa  187  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.67 
 
 
203 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  54.17 
 
 
211 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  51.44 
 
 
201 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.44 
 
 
201 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  62.37 
 
 
199 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  55.79 
 
 
194 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  58.97 
 
 
197 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.85 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  54.82 
 
 
204 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  50.8 
 
 
203 aa  168  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.17 
 
 
216 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  56.63 
 
 
202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.96 
 
 
202 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.82 
 
 
203 aa  154  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  41.27 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  60.87 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  48.78 
 
 
215 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  46.88 
 
 
212 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  49.49 
 
 
200 aa  147  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.11 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  42.65 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  45.89 
 
 
226 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  46.27 
 
 
202 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.67 
 
 
212 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.37 
 
 
226 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  46.7 
 
 
203 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  44.15 
 
 
191 aa  141  6e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.49 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.28 
 
 
200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  44.5 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.33 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.54 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.27 
 
 
202 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  43.08 
 
 
196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  44.79 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.35 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.94 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  44.92 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  44.68 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  45.99 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  44.67 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.61 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.56 
 
 
207 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  46.07 
 
 
197 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.98 
 
 
203 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  44.34 
 
 
213 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.49 
 
 
203 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.49 
 
 
203 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  42.35 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.67 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.26 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.9 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.83 
 
 
207 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.2 
 
 
200 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.82 
 
 
215 aa  131  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  43.81 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.49 
 
 
203 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  43.81 
 
 
211 aa  131  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.81 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.63 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  42.63 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.49 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.02 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  41.29 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  44.33 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0964  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.11 
 
 
190 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.71 
 
 
203 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.08 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.42 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  46.84 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.65 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>