More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3073 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 		 202 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  67.16 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  68.16 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  68.16 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  61.69 
 
 		 203 aa  218  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  65.97 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  63.18 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.38 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  56.28 
 
 		 214 aa  195  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  64.32 
 
 		 200 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  54.89 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.38 
 
 		 197 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  58.7 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.5 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  54.82 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.76 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  52.28 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.03 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  51.78 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  56.76 
 
 		 196 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  58.38 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  56.19 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  53.97 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  52.88 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.8 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  53.8 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  53.23 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  61.46 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  62.12 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  56.15 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  60.22 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.35 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  45.26 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  56.68 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  51.79 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  51.67 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.43 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.92 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.44 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  49.21 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  53.51 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.26 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.6 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.26 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  53.96 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.21 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  55.91 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  55.38 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  45.69 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  45.36 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  50.83 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  51.6 
 
 		 197 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.39 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  57.46 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  45.03 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  48.65 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.07 
 
 		 202 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  53.73 
 
 		 202 aa  140  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.03 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  46.32 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  36.96 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  44.92 
 
 		 209 aa  137  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  44.04 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  44.44 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  44.16 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.03 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  45.79 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  38.8 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.71 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2760  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.39 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.79 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.85 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.15 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  43.08 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  44.26 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  44.26 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.74 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  44.32 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  49.74 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.74 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2113  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.44 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  38.59 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.03 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.03 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3772  protein of unknown function DUF205  50 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  38.92 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  47.09 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.81 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  40.74 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1045  membrane protein  43.72 
 
 		 192 aa  127  8.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  37.23 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  41.18 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>