295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2504 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  100 
 
 		 285 aa  585  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  51.38 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  46.18 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  46.01 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  46.18 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  43.21 
 
 		 308 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  41.81 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  41.46 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  41.46 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  40.69 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  42.24 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  41.81 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  41.11 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  41.81 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  40.77 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  41.52 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21330  Taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  42.96 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  40.55 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  40.77 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  41.52 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  39.52 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.89 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.93 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  40.97 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  40.62 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  40.28 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  37.15 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  39.58 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  38.33 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  39.24 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  39.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  39.18 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  39.18 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  39.18 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  36.96 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  39.18 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  39.18 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  36.59 
 
 		 327 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  36.59 
 
 		 327 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  39.18 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  35.51 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  34.71 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  34.49 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  34.4 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  33.91 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.21 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  32.53 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  32.87 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  32.53 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  36.97 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  31.94 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  32.53 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  35.59 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  34.28 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  36.04 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  32.3 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.57 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  32.87 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  32.29 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  33.1 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  33.56 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  32.52 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  33.33 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  36.52 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  31.94 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  35.82 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  34.4 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.29 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  31.94 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  33.1 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  32.75 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.96 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  32.75 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  32.4 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  31.94 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  34.41 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  35.46 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  31.93 
 
 		 264 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.8 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.76 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  32.62 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.88 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  30.31 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  33.1 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  32.39 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  32.64 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  32.09 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  32.87 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  31.47 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  31.38 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  31.47 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  31.47 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>