More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0752 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  100 
 
 		 330 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  65.34 
 
 		 328 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  65.03 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  65.23 
 
 		 328 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.64 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  64.11 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.22 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  65.85 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.14 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.38 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.75 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.54 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  64.62 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.08 
 
 		 327 aa  428  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64 
 
 		 327 aa  427  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  63.8 
 
 		 327 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  63.69 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.19 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  65.14 
 
 		 328 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.5 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  63.5 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.09 
 
 		 327 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  63.19 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.8 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.77 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.46 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  63.53 
 
 		 329 aa  418  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  61.96 
 
 		 327 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  64 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  62.65 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  63.08 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  62.15 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.74 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  61.23 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  61.3 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.54 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  61.66 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.5 
 
 		 327 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.04 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  65.34 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.12 
 
 		 334 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.49 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.23 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  61.77 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.93 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.98 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  62.58 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.82 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  58.77 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.38 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.08 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  59.26 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  57.44 
 
 		 338 aa  384  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  60.32 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  60.25 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.61 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  59.57 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.74 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  57.36 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.11 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.13 
 
 		 325 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  60.19 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  60.63 
 
 		 738 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.76 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.82 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.2 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6131  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.85 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  55.05 
 
 		 330 aa  351  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 		 327 aa  349  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.74 
 
 		 325 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  54.27 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.74 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.1 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 		 326 aa  345  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.88 
 
 		 331 aa  346  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 324 aa  342  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  52.62 
 
 		 324 aa  342  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.05 
 
 		 342 aa  342  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  52.29 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  52.31 
 
 		 324 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.31 
 
 		 324 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  52.31 
 
 		 324 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3632  alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.62 
 
 		 326 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  55.35 
 
 		 331 aa  341  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  52.92 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  52.31 
 
 		 324 aa  340  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.1 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  52.62 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  54.27 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>