24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3066 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3066  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1646    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00683748  decreased coverage  0.00952273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3563  hypothetical protein  24.28 
 
 		 900 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3278  hypothetical protein  23.63 
 
 		 900 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.887347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0605  outer membrane fimbrial user protein  23.63 
 
 		 894 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6645  outermembrane fimbrial usher protein  22.91 
 
 		 900 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3387  hypothetical protein  24.15 
 
 		 894 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0215  outermembrane fimbrial usher protein  23.03 
 
 		 875 aa  67.4  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0152317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3248  outermembrane fimbrial usher protein  23.03 
 
 		 910 aa  60.1  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0036  fimbrial usher family protein  24.25 
 
 		 872 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0340  hypothetical protein  23.01 
 
 		 895 aa  57.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.638393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0347  TcfC protein  23.3 
 
 		 895 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0932799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4688  hypothetical protein  21.31 
 
 		 836 aa  51.2  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000356334  unclonable  0.00000000000739764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3313  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 		 841 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0317  hypothetical protein  23.43 
 
 		 841 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0205782  hitchhiker  0.00830158 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3328  hypothetical protein  22.54 
 
 		 841 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0301  hypothetical protein  22.54 
 
 		 841 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.974052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00250  predicted aromatic compound dioxygenase  23.43 
 
 		 841 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00253  hypothetical protein  23.43 
 
 		 841 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4439  hypothetical protein  22.08 
 
 		 822 aa  48.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0617  P pilus assembly protein porin PapC-like protein  23.29 
 
 		 948 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.309663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0590  P pilus assembly protein porin PapC-like protein  23.29 
 
 		 948 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0622  P pilus assembly protein porin PapC-like protein  23.29 
 
 		 948 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.563301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0337  hypothetical protein  28.67 
 
 		 841 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.365908  normal  0.874038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1504  putative enzyme  30.88 
 
 		 840 aa  47.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>