More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2178 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.09 
 
 		 690 aa  723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  52.04 
 
 		 690 aa  725    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.2 
 
 		 712 aa  720    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  48.99 
 
 		 691 aa  674    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.97 
 
 		 690 aa  734    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.39 
 
 		 690 aa  725    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  49.35 
 
 		 691 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  47.13 
 
 		 703 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.09 
 
 		 690 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.66 
 
 		 692 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.9 
 
 		 692 aa  722    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.6 
 
 		 691 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.82 
 
 		 690 aa  735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.68 
 
 		 690 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.15 
 
 		 691 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.09 
 
 		 690 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  52.12 
 
 		 690 aa  739    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.82 
 
 		 691 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.09 
 
 		 690 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 686 aa  1420    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.72 
 
 		 694 aa  706    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  52.41 
 
 		 690 aa  733    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.18 
 
 		 721 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.02 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.73 
 
 		 714 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.36 
 
 		 714 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.22 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.74 
 
 		 708 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.15 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.15 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  35.77 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.64 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.15 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.15 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.46 
 
 		 725 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.03 
 
 		 714 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.44 
 
 		 707 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.68 
 
 		 720 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.33 
 
 		 711 aa  425  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.33 
 
 		 700 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.68 
 
 		 716 aa  360  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.1 
 
 		 692 aa  360  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.24 
 
 		 699 aa  352  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.76 
 
 		 758 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.62 
 
 		 729 aa  349  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.72 
 
 		 710 aa  349  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.94 
 
 		 715 aa  347  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.24 
 
 		 699 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.34 
 
 		 741 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.45 
 
 		 738 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.13 
 
 		 701 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.95 
 
 		 725 aa  340  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  33 
 
 		 714 aa  336  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  33 
 
 		 714 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  31.8 
 
 		 750 aa  336  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  33 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  33 
 
 		 714 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.67 
 
 		 732 aa  333  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.86 
 
 		 714 aa  333  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.52 
 
 		 716 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 716 aa  330  7e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  33.29 
 
 		 716 aa  329  8e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  33.29 
 
 		 716 aa  329  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  33.29 
 
 		 716 aa  329  8e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 		 716 aa  329  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 762 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 		 716 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 		 716 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.39 
 
 		 726 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.39 
 
 		 726 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.39 
 
 		 726 aa  321  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  29.72 
 
 		 664 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  30.28 
 
 		 832 aa  260  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.86 
 
 		 659 aa  258  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  29.94 
 
 		 822 aa  253  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  31.84 
 
 		 661 aa  253  9.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  29.32 
 
 		 840 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  29.33 
 
 		 843 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.81 
 
 		 851 aa  248  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  28.55 
 
 		 876 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  28.26 
 
 		 660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.33 
 
 		 934 aa  233  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.2 
 
 		 930 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.2 
 
 		 934 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  28.61 
 
 		 843 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.18 
 
 		 934 aa  231  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.7 
 
 		 957 aa  230  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  28.34 
 
 		 639 aa  229  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.61 
 
 		 934 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  28.28 
 
 		 707 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.99 
 
 		 652 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.61 
 
 		 934 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.93 
 
 		 652 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  27.01 
 
 		 646 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  28.55 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.63 
 
 		 934 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.55 
 
 		 934 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.55 
 
 		 934 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.55 
 
 		 934 aa  221  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.55 
 
 		 934 aa  221  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>