More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1255 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  100 
 
 		 334 aa  697    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  82.93 
 
 		 335 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  47.33 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  49.46 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  50.9 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0692  ATPase  47.67 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2329  gas vesicle protein GvpN  46 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0076  ATPase associated with various cellular activities  50.38 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0615822  decreased coverage  0.000700861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2334  gas vesicle protein GvpN  46.44 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  45.91 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  39.12 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  37.3 
 
 		 437 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2375  gas vesicle protein GvpN  42.53 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0333  gas vesicle protein GvpN  43.51 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3582  ATPase  39.53 
 
 		 316 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3267  ATPase  39.15 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0883928  normal  0.16657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.78 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  28.03 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.54 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.5 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  25.11 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.54 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  24.22 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  24.48 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.31 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  24.62 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  25.33 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  22.29 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.4 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  24.14 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  25.13 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  24.66 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.64 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  23.98 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  23.98 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  23.98 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  25.51 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  24 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  22.39 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  23.98 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  23.72 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  23.11 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  23.59 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  24.22 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.11 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.5 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  24.89 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.27 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  23.5 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  23.59 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.67 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  23.15 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  23.61 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  23.59 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  24.43 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  21.99 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  22.48 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.33 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.31 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.75 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  22.62 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  24.89 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  23.98 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  25 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.93 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  23.77 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  22.79 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  23.01 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  23.01 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  24.9 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  23.35 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  23.11 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  23.17 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  23.39 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  24.49 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  23.15 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  26.24 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  23.92 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  22.34 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  32.41 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  22.75 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.37 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.01 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  24.43 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0387  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.01 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  24.43 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  23.92 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  24.88 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  34.02 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.18 
 
 		 855 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  33.33 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  28.89 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  22.34 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.73 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  21.32 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  24.87 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.21 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  33.05 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  23.19 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>