More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3121 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  533  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  94.21 
 
 
259 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  75.77 
 
 
260 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  74.03 
 
 
260 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  73.62 
 
 
255 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  73.62 
 
 
255 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  73.23 
 
 
255 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  65.88 
 
 
257 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  65.22 
 
 
254 aa  358  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  65.22 
 
 
254 aa  358  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  65.22 
 
 
254 aa  358  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  65.22 
 
 
254 aa  358  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  64.82 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  64.82 
 
 
254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  64.43 
 
 
254 aa  355  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  64.43 
 
 
254 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 
257 aa  352  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  64.03 
 
 
254 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  63.89 
 
 
256 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  63.89 
 
 
256 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  63.89 
 
 
256 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  63.89 
 
 
256 aa  348  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  63.49 
 
 
256 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  51.46 
 
 
257 aa  255  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  46.8 
 
 
255 aa  248  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  47.6 
 
 
255 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  45.38 
 
 
258 aa  245  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  45.14 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  45.08 
 
 
266 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  45.08 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  44.67 
 
 
280 aa  214  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 
258 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  44.26 
 
 
258 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  43.85 
 
 
258 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  43.03 
 
 
258 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 
258 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
259 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 
264 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  42.15 
 
 
252 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 
258 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 
258 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  42.68 
 
 
257 aa  201  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
255 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  40.77 
 
 
260 aa  198  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  38.91 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  43.15 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
253 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  36.86 
 
 
265 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  40 
 
 
268 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  40.8 
 
 
271 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  39.56 
 
 
230 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  42.98 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 
256 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 
255 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  37.84 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
252 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
227 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 
254 aa  158  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  37.92 
 
 
259 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 
257 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  35.74 
 
 
235 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  37.66 
 
 
256 aa  151  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  34.29 
 
 
253 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
253 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 
264 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
254 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  35.18 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  34.4 
 
 
261 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 
255 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  31.8 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
281 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.2 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  32.02 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  30.04 
 
 
306 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
282 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.4 
 
 
277 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
265 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  27.59 
 
 
293 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  29.18 
 
 
356 aa  96.3  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.94 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  43.69 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39469  predicted protein  26.12 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.696258  normal  0.903169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>