30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2463 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  53.04 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  41.63 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  37.61 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  39.15 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  37.95 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  37.95 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  40.58 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  40.58 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  39.86 
 
 		 328 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  39.86 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  38.51 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  31.09 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  30.71 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  30.5 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  28.51 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  30.71 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.46 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  29.58 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.2 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  38.2 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  24.22 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  27.59 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  25.69 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  27.87 
 
 		 478 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1597  hypothetical protein  48 
 
 		 78 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  28.06 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  27.66 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  26.48 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>