More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3966 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3966  FeS assembly ATPase SufC  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1627  ATP-dependent transporter  88 
 
 		 251 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  hitchhiker  0.00197674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2359  FeS assembly ATPase SufC  85.6 
 
 		 251 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0744397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2360  FeS assembly ATPase SufC  84.68 
 
 		 252 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0437  SUF C, ATPase  85.08 
 
 		 252 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1245  FeS assembly ATPase SufC  86.4 
 
 		 251 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2092  FeS assembly ATPase SufC  84.27 
 
 		 252 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4468  FeS assembly ATPase SufC  74.9 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2591  FeS assembly ATPase SufC  71.6 
 
 		 248 aa  358  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308919  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2839  FeS assembly ATPase SufC  69.55 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5930  ABC transporter associated with Fe-S cluster assembly, ATP binding protein  67.87 
 
 		 253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2743  FeS assembly ATPase SufC  68.72 
 
 		 252 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.858995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  70.12 
 
 		 249 aa  355  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3967  hypothetical protein  67.89 
 
 		 250 aa  354  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.147805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5847  FeS assembly ATPase SufC  70.2 
 
 		 250 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0102923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2992  FeS assembly ATPase SufC  68.72 
 
 		 252 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584869 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5108  FeS assembly ATPase SufC  68.98 
 
 		 250 aa  353  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1663  FeS assembly ATPase SufC  67.48 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2105  FeS assembly ATPase SufC  65.18 
 
 		 251 aa  352  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2457  FeS assembly ATPase SufC  68.72 
 
 		 252 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2436  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.06 
 
 		 251 aa  352  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0558261  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  69.35 
 
 		 247 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0999  FeS assembly ATPase SufC  70.37 
 
 		 256 aa  352  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0728  FeS assembly ATPase SufC  69.55 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01978  FeS assembly ATPase SufC  69.14 
 
 		 254 aa  352  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.486472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1898  FeS assembly ATPase SufC  64.78 
 
 		 262 aa  351  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111846 
 
 
-
 
NC_004310  BR0932  ABC transporter, ATP-binding protein  65.06 
 
 		 251 aa  351  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0817  ABC transporter ATP-binding protein  69.14 
 
 		 280 aa  351  8e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0926  FeS assembly ATPase SufC  65.06 
 
 		 280 aa  351  8e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  64.66 
 
 		 251 aa  351  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1317  FeS assembly ATPase SufC  68.25 
 
 		 254 aa  350  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00252118  normal  0.400998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0671  FeS assembly ATPase SufC  67.07 
 
 		 247 aa  348  6e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.814843  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1780  FeS assembly ATPase SufC  65.86 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  68.03 
 
 		 247 aa  344  7e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  67.35 
 
 		 250 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  63.16 
 
 		 251 aa  342  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2327  FeS assembly ATPase SufC  65.85 
 
 		 249 aa  342  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.486674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0085  FeS assembly ATPase SufC  65.84 
 
 		 253 aa  340  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0099  FeS assembly ATPase SufC  67.07 
 
 		 251 aa  338  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.842965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3310  FeS assembly ATPase SufC  64.54 
 
 		 257 aa  336  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0266816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  63.86 
 
 		 261 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0538  FeS assembly ATPase SufC  65.02 
 
 		 250 aa  333  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  65.85 
 
 		 257 aa  333  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2572  FeS assembly ATPase SufC  61.72 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.023273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  64.66 
 
 		 247 aa  332  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  63.41 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0811  FeS assembly ATPase SufC  61.04 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0160025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0991  FeS assembly ATPase SufC  64.75 
 
 		 254 aa  328  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4270  FeS assembly ATPase SufC  63.45 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0977  iron-regulated ABC transporter, ATP-binding protein  61.45 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  63.75 
 
 		 254 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  62.95 
 
 		 250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  62.8 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2489  FeS assembly ATPase SufC  63.93 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5778  FeS assembly ATPase SufC  62.4 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  62.25 
 
 		 248 aa  322  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0726  FeS assembly ATPase SufC  63.37 
 
 		 249 aa  322  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.860961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0241  hypothetical protein  62.4 
 
 		 249 aa  321  6e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3039  FeS assembly ATPase SufC  61.35 
 
 		 255 aa  321  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0647641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  61.85 
 
 		 250 aa  321  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0580  FeS assembly ATPase SufC  61.29 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0529353  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  64.2 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01358  Cysteine desulfurase activator ATPase  64.81 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1699  FeS assembly ATPase SufC  62.55 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1503  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524279  hitchhiker  0.000000451745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1607  FeS assembly ATPase SufC  64.66 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00745955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1468  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.630642  normal  0.055193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1971  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000984202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1800  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 		 248 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.018304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0175  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 		 251 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.000000823487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1484  cysteine desulfurase ATPase component  61.79 
 
 		 248 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000473069 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1447  ATP-dependent transporter  61.38 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.629714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1514  FeS assembly ATPase SufC  61.38 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1743  cysteine desulfurase ATPase component  60.98 
 
 		 248 aa  314  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0361641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1762  cysteine desulfurase ATPase component  60.98 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.129847  hitchhiker  0.0000268298 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1849  cysteine desulfurase ATPase component  60.98 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  62.14 
 
 		 246 aa  311  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1883  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.729578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1898  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00275975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1960  FeS assembly ATPase SufC  60.57 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.470246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1514  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2396  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0319212  hitchhiker  0.000467417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01651  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01641  hypothetical protein  60.57 
 
 		 248 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2592  cysteine desulfurase ATPase component  60.57 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2181  cysteine desulfurase ATPase component  60.64 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0257166  hitchhiker  0.000554392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1763  cysteine desulfurase ATPase component  60.16 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1949  cysteine desulfurase ATPase component  60.16 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0425  FeS assembly ATPase SufC  61.13 
 
 		 262 aa  307  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0653  hypothetical protein  58.94 
 
 		 250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0844  FeS assembly ATPase SufC  65.43 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0894  FeS assembly ATPase SufC  65.43 
 
 		 268 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0890  FeS assembly ATPase SufC  65.02 
 
 		 268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4730  FeS assembly ATPase SufC  60.64 
 
 		 256 aa  305  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4356  FeS assembly ATPase SufC  59.29 
 
 		 271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.563554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3354  FeS assembly ATPase SufC  58.8 
 
 		 254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.267766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>