More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1277 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  68.89 
 
 		 495 aa  673    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  68.51 
 
 		 495 aa  646    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  67.69 
 
 		 495 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 496 aa  963    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  70.02 
 
 		 494 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  68.51 
 
 		 495 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  68.83 
 
 		 493 aa  631  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  67.01 
 
 		 490 aa  619  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  63.58 
 
 		 499 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  58.47 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  56.61 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  57.62 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  61.09 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  54.03 
 
 		 468 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  56.2 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  56.61 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  54.89 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  53.66 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  57.4 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  52.22 
 
 		 482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  54.32 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  53.99 
 
 		 458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  54.4 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  54.32 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  54.4 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  54.19 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  53.58 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  53.99 
 
 		 458 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  53.58 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  53.54 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  49.49 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  49.49 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  49.49 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  49.49 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  49.49 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  52.77 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  49.49 
 
 		 525 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  49.49 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  50.91 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  50.91 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  49.28 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  52.94 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  50.85 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  53.31 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  48.15 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  47.56 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  47.93 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  47.93 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  48.37 
 
 		 449 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  46.34 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  46.11 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  45.15 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  44.79 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  47.33 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  47.12 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  44.91 
 
 		 451 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  44.91 
 
 		 451 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  44.7 
 
 		 451 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  44.07 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  42.26 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  45.42 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  43.52 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  42.97 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  41.86 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  39.23 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  40.55 
 
 		 647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  41.5 
 
 		 457 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  40.5 
 
 		 825 aa  336  5.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  40.5 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  40.13 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  40.35 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  42.86 
 
 		 633 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  40.56 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  42.05 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  41.27 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  41.32 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  40.21 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  39.71 
 
 		 518 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  39.13 
 
 		 509 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  38.29 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  39.51 
 
 		 506 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  41.11 
 
 		 449 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  38.52 
 
 		 501 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  39.14 
 
 		 485 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  38.43 
 
 		 493 aa  312  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  41.42 
 
 		 665 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0068  xanthine permease  37.96 
 
 		 422 aa  310  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  38.89 
 
 		 505 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  40.09 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  38.68 
 
 		 505 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  38.89 
 
 		 505 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  37.26 
 
 		 566 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>