126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2856 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  67.24 
 
 		 174 aa  244  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.13 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  63.1 
 
 		 170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.48 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.43 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  61.36 
 
 		 133 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  50 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.56 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.21 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.21 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  39.55 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.98 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.24 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  33.94 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.99 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.8 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  41.46 
 
 		 344 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.55 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  32.76 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.37 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.43 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.89 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.65 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.62 
 
 		 407 aa  68.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.7 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.34 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  44.83 
 
 		 385 aa  64.3  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.55 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.74 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.7 
 
 		 334 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.33 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  29.24 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  29.12 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  31.45 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  31.45 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  31.45 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  31.45 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  31.45 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.7 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.82 
 
 		 352 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.4 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  30.82 
 
 		 352 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  32.47 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.12 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  29.68 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.12 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.14 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  28.65 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  30.25 
 
 		 404 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  30.25 
 
 		 404 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.82 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.64 
 
 		 330 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  29.63 
 
 		 404 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.37 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  30.07 
 
 		 353 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.95 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.04 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  32 
 
 		 343 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  29.45 
 
 		 414 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  27.85 
 
 		 359 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  27.85 
 
 		 359 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.27 
 
 		 412 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  30.77 
 
 		 373 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  28 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.62 
 
 		 375 aa  49.3  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.91 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  30.25 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  29.01 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  29.01 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  29.01 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  29.01 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  36.89 
 
 		 355 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  28.21 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  27.21 
 
 		 408 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  27.87 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 403 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  30.56 
 
 		 371 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.94 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.74 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.73 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  36.78 
 
 		 428 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.68 
 
 		 415 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  28.48 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.59 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  26.35 
 
 		 423 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  27.78 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.53 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  25.85 
 
 		 408 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>