More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1952 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  100 
 
 		 143 aa  293  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  64.75 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  62.04 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  63.5 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  61.31 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  62.77 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  56.92 
 
 		 167 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  56.92 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  56.92 
 
 		 167 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  51.77 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  52.48 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  51.43 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  51.54 
 
 		 176 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  53.62 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  47.89 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  47.14 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  45.32 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  42.86 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  42.86 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  42.86 
 
 		 157 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  42.96 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  43.38 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  42.45 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  43.26 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  42.45 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  41.26 
 
 		 149 aa  121  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  43.26 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  45.65 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  45.31 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  41.48 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  41.55 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  42.66 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  44.06 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  39.71 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  40.41 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  40 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  41.26 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  44.09 
 
 		 167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  39.73 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  39.73 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  39.73 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  39.73 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  39.73 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  41.5 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  41.5 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  41.73 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  37.96 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  46.22 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  37.88 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  37.31 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  39.42 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  37.67 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  43.51 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  43.51 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  40.15 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  37.06 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  39.72 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  42.22 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1610  ferric uptake regulator, Fur family  37.59 
 
 		 174 aa  106  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596418  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  44 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2385  ferric uptake regulator family protein  42.22 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  41.1 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  40.97 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  43.2 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  38.24 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  43.2 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  36.03 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  43.2 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  41.86 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  38.17 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  39.26 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  40.56 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  38.17 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  42.75 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  41.41 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  43.09 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  38.35 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  45.6 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  42.28 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  40.46 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  41.86 
 
 		 181 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  37.96 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  40 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  42.97 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  42.74 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>