More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0114 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  50.66 
 
 		 304 aa  332  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  52.82 
 
 		 304 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  48.2 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  48.04 
 
 		 315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  46.41 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  50.33 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  46.84 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.08 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.08 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  46.08 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  50.17 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  46.08 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  45.75 
 
 		 318 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  45.75 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  45.75 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  46.91 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  46.91 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  48.51 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  47.12 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  48.34 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  48.84 
 
 		 310 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  46.25 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  48.03 
 
 		 302 aa  289  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  45.6 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  46.51 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  48.54 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  46.38 
 
 		 319 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  48.01 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  50.66 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  45.1 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  46.33 
 
 		 310 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  47.68 
 
 		 332 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  45.83 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  45.07 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  46.6 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  45.81 
 
 		 318 aa  280  3e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  46.53 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  46.03 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  46.71 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  43.69 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  43.79 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  46.71 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  45.98 
 
 		 313 aa  277  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  44.34 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  44.74 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.33 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 330 aa  275  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  43.79 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  46.86 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  43.46 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  47.25 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.7 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  45.45 
 
 		 311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.84 
 
 		 427 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  47 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  45.33 
 
 		 317 aa  271  7e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  45.37 
 
 		 361 aa  271  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 333 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 333 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 333 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  45.07 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  44.81 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  46.41 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  43.46 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  45 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  47.35 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  47.52 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  45.7 
 
 		 314 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  45.66 
 
 		 362 aa  268  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  45.28 
 
 		 333 aa  268  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  45.7 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0331  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  46.05 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  45.75 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  45.75 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  45.95 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  46.69 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  44.59 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  43.26 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  42.81 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  43.18 
 
 		 311 aa  265  7e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  45.34 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  44.81 
 
 		 311 aa  265  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  42.53 
 
 		 320 aa  265  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  43.51 
 
 		 331 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  46.69 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  44.04 
 
 		 359 aa  264  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  46.2 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  46.71 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>