57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2274 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2274  V-type ATP synthase subunit K  100 
 
 
89 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1052  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  68.97 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.32 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  62.79 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.274435 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0018  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  71.05 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.62 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.05 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  45.16 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  45.16 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  45.16 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  45.16 
 
 
222 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  41.54 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.39 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  45.16 
 
 
223 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.69 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.31 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  43.33 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  67.74 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  41.67 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  50.85 
 
 
232 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  41.67 
 
 
190 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  41.67 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 
321 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.55 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
606 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.54 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  40 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.67 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  40.28 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  37.7 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  37.7 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 
122 aa  43.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  33.33 
 
 
164 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  33.33 
 
 
164 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 
81 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 
81 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17928  predicted protein  45.9 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 
81 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 
81 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  42.25 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  33.82 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  42.37 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.94 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2368  V-type ATP synthase subunit K  45.45 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  33.87 
 
 
154 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  34.43 
 
 
237 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>