33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1613 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 		 85 aa  153  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  62.12 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  57.58 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.09 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  54.55 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  47.76 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  46.27 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.06 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1239  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  53.12 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.38 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  40.91 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  40.91 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  40.91 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  40.91 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1433  A-type ATP synthase subunit K  47.27 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.31 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  37.88 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.62 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.46 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3349  hypothetical protein  46.81 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  38.24 
 
 		 232 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0277  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.51 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.571155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2051  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.710872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  40.98 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.06 
 
 		 606 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 81 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>