51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0018 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0018  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 
88 aa  160  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1052  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  71.11 
 
 
93 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  71.59 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.274435 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2274  V-type ATP synthase subunit K  71.05 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  51.47 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.13 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.94 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.94 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50.75 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50.75 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  41.94 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  41.94 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  41.94 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  41.94 
 
 
222 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  40.62 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  43.33 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  41.67 
 
 
151 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  40.32 
 
 
223 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  41.67 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  41.67 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.43 
 
 
606 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  49.25 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  41.67 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.38 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  38.03 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
321 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
73 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  45.16 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  39.06 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  39.06 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  31.4 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  41.18 
 
 
232 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  35.44 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  35.44 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  35.29 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  44.19 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  33.72 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  44.78 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.7 
 
 
138 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  38.24 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 
76 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>