31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0283 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 		 82 aa  150  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  84.21 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  76.32 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  81.71 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  84.85 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  63.08 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  61.54 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1239  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  68.66 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  54.55 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1433  A-type ATP synthase subunit K  54.24 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  43.08 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  43.08 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  43.08 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  43.08 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  43.08 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.67 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.58 
 
 		 606 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.88 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.18 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1449  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0399378  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0277  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.09 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.571155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  46.77 
 
 		 232 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3349  hypothetical protein  55.32 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2568  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.55 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0859386  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  36.71 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2672  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.76 
 
 		 71 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2767  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.76 
 
 		 71 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000764187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1198  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.76 
 
 		 71 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0357317  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1634  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1920  V-type ATP synthase subunit K  48.39 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.418171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1763  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.86 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>