30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1014 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 
142 aa  267  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.67 
 
 
142 aa  87  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19430  V-type ATP synthase subunit C  46.27 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.7 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2086  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  55.38 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.185721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3445  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.57 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.59 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.08 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  39.39 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3459  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.54 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  39.51 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  36.11 
 
 
82 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  35.29 
 
 
223 aa  50.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  36.49 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.33 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  35.38 
 
 
222 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  35.38 
 
 
222 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  35.38 
 
 
222 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  35.38 
 
 
222 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1433  A-type ATP synthase subunit K  40.68 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  40.28 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  40.28 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  40.28 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1449  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.27 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0399378  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  35.94 
 
 
81 aa  43.9  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  34.38 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1920  V-type ATP synthase subunit K  39.13 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.418171  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1634  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.63 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.86 
 
 
82 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.211164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>