26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17928 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17928  predicted protein  100 
 
 		 168 aa  325  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  57.14 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  57.14 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16442  predicted protein  68.48 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.746613  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13096  predicted protein  54.17 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15145  predicted protein  51.81 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449237  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  49.03 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22609  predicted protein  44.51 
 
 		 181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552816  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  49.04 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  44.03 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  43.67 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.406866 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  40.37 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14544  predicted protein  45.25 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  43.87 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.291766 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  38.41 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  39.29 
 
 		 237 aa  101  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86847  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  36.05 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13768  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  30.57 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.518766  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  39.81 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07603  V-ATPase proteolipid subunit Ppa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15560)  32.48 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.094688  normal  0.0276885 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11649  predicted protein  32.35 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  37.5 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 		 76 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 		 76 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 		 76 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.93 
 
 		 606 aa  41.6  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>