25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_87235 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  100 
 
 
163 aa  311  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  67.11 
 
 
164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  59.87 
 
 
190 aa  172  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  55.92 
 
 
160 aa  167  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  59.03 
 
 
159 aa  165  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  53.95 
 
 
161 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  59.06 
 
 
237 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  55.84 
 
 
170 aa  159  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  55.84 
 
 
170 aa  159  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22609  predicted protein  41.82 
 
 
181 aa  128  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552816  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15145  predicted protein  45.57 
 
 
162 aa  127  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449237  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13096  predicted protein  46.54 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  41.26 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14544  predicted protein  37.43 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  42.86 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17928  predicted protein  43.87 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  52.17 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16442  predicted protein  46.41 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.746613  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13768  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  33.12 
 
 
211 aa  70.9  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.518766  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86847  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  31.25 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23706  predicted protein  35.46 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0031909  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07603  V-ATPase proteolipid subunit Ppa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15560)  29.76 
 
 
200 aa  61.6  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.094688  normal  0.0276885 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11649  predicted protein  29.25 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.7 
 
 
606 aa  51.2  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0252  H+transporting two-sector ATPase C subunit  31.47 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>