27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0252 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0252  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 
157 aa  294  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1690  V-type ATP synthase subunit K  56.76 
 
 
156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  60.56 
 
 
164 aa  164  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  59.86 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2368  V-type ATP synthase subunit K  50.98 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2263  V-type ATP synthase subunit K  41.96 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0854  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.62 
 
 
167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3076  V-type ATP synthase subunit K  52.54 
 
 
170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1807  v-type ATPase, subunit K  39.86 
 
 
158 aa  84.7  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  37.86 
 
 
222 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  37.86 
 
 
222 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  37.86 
 
 
222 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1505  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.8 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  36.36 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  37.86 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.44 
 
 
606 aa  64.7  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1554  H+transporting two-sector ATPase C subunit  30.47 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  31.67 
 
 
232 aa  53.9  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  30.28 
 
 
159 aa  51.2  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  31.47 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  28.08 
 
 
190 aa  48.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0578  V-type ATP synthase subunit K  30.28 
 
 
141 aa  47  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.45725  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  27.33 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  27.33 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  44.07 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  44.07 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>