20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0578 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0578  V-type ATP synthase subunit K  100 
 
 
141 aa  268  2e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.45725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2897  V-type ATP synthase subunit K  45.67 
 
 
149 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00696895  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3223  V-type ATP synthase subunit K  45.67 
 
 
149 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  31.39 
 
 
164 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  31.62 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1807  v-type ATPase, subunit K  31.69 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1690  V-type ATP synthase subunit K  28.78 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1554  H+transporting two-sector ATPase C subunit  26.98 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2263  V-type ATP synthase subunit K  25.71 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  28.89 
 
 
222 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  28.89 
 
 
222 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1505  H+transporting two-sector ATPase C subunit  27.56 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  28.89 
 
 
222 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3076  V-type ATP synthase subunit K  34.17 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  29.85 
 
 
223 aa  47  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0252  H+transporting two-sector ATPase C subunit  30.28 
 
 
157 aa  47  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  35.94 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0854  H+transporting two-sector ATPase C subunit  29.87 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1831  V-type ATP synthase subunit K  31.5 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1679  V-type ATP synthase subunit K  26.28 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000026282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>