27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1894 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  100 
 
 		 164 aa  317  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  98.78 
 
 		 164 aa  313  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1690  V-type ATP synthase subunit K  59.48 
 
 		 156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0252  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.86 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2368  V-type ATP synthase subunit K  55.63 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2263  V-type ATP synthase subunit K  48.59 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0854  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.15 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3076  V-type ATP synthase subunit K  54.48 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1505  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.27 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  40.69 
 
 		 222 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  40.69 
 
 		 222 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  40.69 
 
 		 222 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  40 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1554  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.17 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  42.36 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1807  v-type ATPase, subunit K  38.19 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  30.99 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 		 606 aa  65.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0578  V-type ATP synthase subunit K  31.62 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.45725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3223  V-type ATP synthase subunit K  30.72 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2897  V-type ATP synthase subunit K  30.72 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00696895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1679  V-type ATP synthase subunit K  33.1 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000026282  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  27.14 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  26.03 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  26.03 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.19 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  25.52 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.406866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>