30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69588 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  100 
 
 
160 aa  307  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  76.1 
 
 
161 aa  248  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  77.99 
 
 
190 aa  244  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  56.88 
 
 
164 aa  177  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  59.12 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  59.12 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  60.14 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  55.92 
 
 
163 aa  167  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  71.17 
 
 
151 aa  149  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  52.98 
 
 
237 aa  141  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  73.2 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15145  predicted protein  45.22 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449237  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22609  predicted protein  41.92 
 
 
181 aa  127  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13096  predicted protein  43.1 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  39.16 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17928  predicted protein  43.67 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14544  predicted protein  35.03 
 
 
189 aa  103  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16442  predicted protein  45.62 
 
 
168 aa  99  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.746613  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86847  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  35.62 
 
 
196 aa  89.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13768  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  31.61 
 
 
211 aa  85.1  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.518766  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07603  V-ATPase proteolipid subunit Ppa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15560)  31.21 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.094688  normal  0.0276885 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11649  predicted protein  28.77 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23706  predicted protein  32.64 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0031909  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  32.26 
 
 
232 aa  48.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02380  hydrogen-transporting ATPase, putative  41.67 
 
 
208 aa  48.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235979  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.45 
 
 
606 aa  44.7  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  25.52 
 
 
164 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  25.52 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2263  V-type ATP synthase subunit K  26.53 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1690  V-type ATP synthase subunit K  24.29 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>