25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11649 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11649  predicted protein  100 
 
 
173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07603  V-ATPase proteolipid subunit Ppa1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15560)  56.73 
 
 
200 aa  178  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.094688  normal  0.0276885 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13768  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  56.47 
 
 
211 aa  177  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.518766  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86847  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  53.09 
 
 
196 aa  170  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21882  predicted protein  34.59 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.854238  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29011  predicted protein  34.59 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00069003  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69588  vacuolar ATPase V0 domain subunit c  28.93 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02690  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35397  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  30.38 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175083  normal  0.827504 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02380  hydrogen-transporting ATPase, putative  58.46 
 
 
208 aa  74.3  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0235979  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13096  predicted protein  32.72 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14544  predicted protein  31.32 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15145  predicted protein  33.99 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449237  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03340  hydrogen ion transporter, putative  29.61 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000569268  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17928  predicted protein  32 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22609  predicted protein  29.94 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552816  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03088  hypothetical protein similar to vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit (Broad)  25.77 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119546  vacuolar type H+-ATPase proteolipid subunit  31.17 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04718  vacuolar ATPase proteolipid subunit c, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08560)  31.62 
 
 
237 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87235  vacuolar ATPase V0 domain subunit c' (17 kDa)  29.38 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.291766 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06127  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  25.44 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10305  vacuolar ATP synthase 16 kDa proteolipid subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12370)  36.92 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813751  normal  0.842238 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.19 
 
 
606 aa  44.7  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  32.43 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16442  predicted protein  30.63 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.746613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>